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企业质量管理体系和工程质量管理体系不同：（1）目的不同。工程质量管理体系只用于特定的工程项目质量管理，而不是用于建筑企业或组织的质量管理，其建立的目的不同。（2）服务范围不同。工程质量管理体系涉及工程项目实施过程所有的质量责任主体，而不只是针对某一个承包企业或组织机构，其服务的范围不同。（3）目标不同。工程质量管理体系的管理目标是工程项目质量目标，并非某一具体建筑企业或组织的质量管理目标，其控制的目标不同。（4）作用时效不同。工程质量管理体系与项目管理组织系统相融合，是一次性的质量工作体系，并非永久性的质量管理体系，其作用的时效不同。（5）评价的方式不同。工程质量管理体系的有效性一般由项目管理的总组织者进行自我评价与诊断，不需进行第三方认证，其评价的方式不同。